森林图快速绘制工具——既不要编程又能直观的展示cox比例分析结果的工具来了!

1. 如果是以文件的格式将数据导入到云平台,平台默认无法读取Excel中的数据,必须将Excel文件转为以制表位符分割的文本文件,否则小工具将无法运行。 2. 森林图不仅能展示单因素cox比例分险结果,同样能展示多因素cox比例分险结果


  
把数据格式用Excel整理好,在粘贴到小工具中,点击鼠标,即可做出高颜值的森林图 



01

研究背景


前面给小伙伴们分享的《简易批量生存分析工具》,使用cox比例风险分析和KM曲线来展示每个基因对患者生存状态的影响。而且在推文中,小编也给大家简要的分析了两者之间的区别,即KM曲线展示的是不连续变量对患者生存的影响。cox比例分析则分析的是连续变量对患者生存状态的影响,其结果是一张表格,里面包括cox比例风险回归的P值,HR以及HR95%的置信区间等结果。

但是这些结果都是用表格展示的,并不直观,插入到文章中也不方面。


私信有小伙伴们对我说,能不能在平台上新增加一个小工具,既不要编程又能直观的展示cox比例分析结果,最重要的是要高颜值。我说没问题,咱们公司的IT小哥哥可是编程高手,一杯咖啡的时间就给小伙伴们写了一个森林图。

有小伙伴不会编程的,把数据格式用Excel整理好,在粘贴到小工具中,点击鼠标,即可做出高颜值的森林图。 


就是这么简单,你只需跨出注册的第一步,剩下的 Sangerbox都替你走完!

快跟着小编一起学习一下这个工具



网址导航

http://sangerbox.com/Tool     点击“森林图快速绘制工具




02


使用方法


1.输入数据

----------

输入数据可以包含若干列,但是必须包含三列,即风险比HR以及95%的上下置信区间,且必须将这三列放在整个表格的最后三列。三列之前可以根据实际需求插入若干列,如cox回归分析结果中的P值等,但是要注意表格中每个数据的格式,如下表所示。

attachments-2020-05-UEnMXVQE5ecc6f5105e09.png


2.软件参数

----------


attachments-2020-05-65MjyEB15ecc6f6086d05.png


3.结果展示

----------


attachments-2020-05-vunuVEFv5ecc6f6bc2b33.png

特别注意

----------

1. 如果是以文件的格式将数据导入到云平台,平台默认无法读取Excel中的数据,必须将Excel文件转为以制表位符分割的文本文件,否则小工具将无法运行。

2. 森林图不仅能展示单因素cox比例分险结果,同样能展示多因素cox比例分险结果



参考文献


[1] Ryan CJ, Smith MR, de Bono JS, et al. Abiraterone in metastatic prostate cancer without previous chemotherapy [published correction appears in N Engl J Med. 2013 Feb 7;368(6):584]. N Engl J Med. 2013;368(2):138‐148. 


具体指引详见:


attachments-2020-05-I0Fdxfuc5ecc6f353427b.png

  • 发表于 2020-05-26 09:25
  • 阅读 ( 96 )
  • 分类:软件工具

0 条评论

请先 登录 后评论
不写代码的码农
柚子

89 篇文章

作家榜 »

  1. 祝让飞 116 文章
  2. 柚子 89 文章
  3. 刘永鑫 64 文章
  4. 生信分析流 52 文章
  5. SXR 44 文章
  6. 调研图 38 文章
  7. 张海伦 31 文章
  8. 爽儿 25 文章