高颜值的相关性计算工具——你爱了吗!

相关性基础知识 “ 相关表和相关图可反映两个变量之间的相互关系及其相关方向,但无法确切地表明两个变量之间相关的程度。 相关系数是用以反映变量之间相关关系密切程度的统计指标。相关系数是按积差方法计算,同样以两变量与各自平均值的离差为基础,通过两个离差相乘来反映两变量之间相关程度;着重研究线性的单相关系数 ”


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相关性基础知识


“    相关表和相关图可反映两个变量之间的相互关系及其相关方向,但无法确切地表明两个变量之间相关的程度。 相关系数是用以反映变量之间相关关系密切程度的统计指标。相关系数是按积差方法计算,同样以两变量与各自平均值的离差为基础,通过两个离差相乘来反映两变量之间相关程度;着重研究线性的单相关系数    




“ 每日一叨 ”


前段时间给大家介绍了很多小工具的使用方法,很多小伙伴给小编反映,说他们属于编程小白,对于生信分析更是渴望而不可及的事,但是通过这些小工具,可以实现一些简单的生信分析,甚至比较难的图也很容易就出来了。


而有些小伙伴反而最简单的图都做不出来,这是为什么呢?

这个问题在云平台中显得尤为重要,有些好数据做出来的图高颜值,而有些杂乱数据甚至导不出来图

因为做数据分析最关键的地方在于数据本身是对数据进行预处理和标准化,这样才能保证后面有正确的结果。


背景介绍


在生物信息领域中相关系数使用很广泛,比如计算免疫评分与基因表达的相关性,计算模型风险得分与通路的相关性等等,今天这款小工具专注解决各种矩阵相关性问题,


摊已经摆好随时欢迎大家使用


网址导航

http://sangerbox.com/Tool     点击“矩阵相关性计算工具




软件参数


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01


示例


输入数据:两个变量之间计算相关性(如下图所示)

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展示结果

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02


示例

几个基因两两之间的相关性

输入数据

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attachments-2020-06-xQQGzGVz5ee721f57d8c4.png

展示结果

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attachments-2020-06-oWqgppv95ee7220771430.png


03


示例

当有十几个基因两两之间的相关性时


输入数据

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展示结果

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04


示例

计算两个矩阵中数据之间的相关性


输入数据

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展示结果

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特别注意:


1.如果是以文件的格式将数据导入到云平台,平台默认无法读取Excel中的数据,必须将Excel文件转为以制表位符分割的文本文件,否则小工具将无法运行。

2.将文件从本地上传到网站上应注意文件名只能用字母、数字或下划线命名不能有空格等特殊字符命名,否则将上传失败。




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  • 发表于 2020-06-15 15:25
  • 阅读 ( 510 )
  • 分类:软件工具

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不写代码的码农
柚子

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