TCGA ID转换器使用说明

为了便于新版TCGA RNA-Seq数据的转换提取,特制作RNA-Seq数据的ENSG_ID转换成lncRNA、编码蛋白基因、假基因等的转换器

首先TCGA下载的RNA-seq数据是ensembl的ID,里面包含了六万多个转录本数据,本工具主要是对该数据进行一些基本的转换:

1、提取其中的蛋白编码基因表达谱

2、提取其中的lncRNA表达谱

3、提取其中的假基因表达谱

数据输入要求:

1、一个矩阵,行为转录本,列为样本

2、第一行为表头

3、第二行开始为各个转录本表达水平

4、第一列为ID列

5、第二列开始为样本表达水平

  • 发表于 2017-08-04 17:05
  • 阅读 ( 7867 )
  • 分类:软件工具

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祝让飞

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