TCGA ID转换器使用案例

以TCGA简易下载工具下载数据为例,首先下载工具下载之后合并矩阵会得到一个名字为:Merge_matrix.txt 的矩阵 矩阵格式上满足本工具的要求: 打开本工具界面极其简单如下: 从图中可以看...

工具下载链接:http://gap.shengxin.ren/tool/9/

以TCGA简易下载工具下载数据为例,首先下载工具下载之后合并矩阵会得到一个名字为:Merge_matrix.txt 的矩阵

矩阵格式上满足本工具的要求:

attachments-2017-08-PDBBbfzr5984788e6d9a

打开本工具界面极其简单如下:

attachments-2017-08-UGYcioml598478ede2fd

从图中可以看出就三步:

step1:选择输入文件即找到Merge_matrix.txt

step2:选择需要转换的数据类型,这里可以多选也可以单选

step3:选择当一个基因遇到多个转录本的时候的处理方式,本工具使用了三种方式:取多个转录本的中位数、均值、其中最大表达的那个转录本

最后点击跑起来就能得到名字为Merge_matrix.txt.cv.xls的文件如下:

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  • 发表于 2017-08-04 21:42
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  • 分类:软件工具

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