TCGA RNASeq数据归一化工具说明
TCGA RNASeq数据提供了三种下载格式，很多新手不知道下载哪种格式的数据比较好，因为一些筛选差异的包比如（edgR等）需要Counts，所以很多人去下载了Counts，然后后续却不知道怎么去处理，当然...
TCGA RNASeq数据提供了三种下载格式，很多新手不知道下载哪种格式的数据比较好，因为一些筛选差异的包比如（edgR等）需要Counts，所以很多人去下载了Counts，然后后续却不知道怎么去处理，当然本小工具也不能处理这个Counts，本来可以通过Counts+gff对Counts进行FPKM换算的，但是这不如直接下载FPKM来的更方便一些，然而除了这三种数据格式之外TCGA没有提供老版本的TPM格式的了，本工具主要来解决这个问题，对FPKM数据做进一步处理，比如转换成TPM，比如z-score，比如取log
本工具主要提供三个功能
1、FPKM转换成TPM(仅限TCGA)
2、z-score换算
3、取log（x+1）
数据输入支持：
1、多个文件输入，gz压缩包，txt文件
2、矩阵文件：TCGA简易小工具的合并的矩阵文件
使用步骤：
1、选择文件
2、选择需要转换的样本
3、选择转换方法
4、转换
- 发表于 2017-09-01 16:49
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- 分类：软件工具
