火山图绘制工具示例

1、首先我们选择一套GEO数据集GSEXXXX,然后使用GEO2R的在线工具(或者使用生信人的差异分析小工具*看这里:如何极其简单的使用GEO数据来做差异分析)筛选差异表达基因,我们将得到所有基因的差...

火山图绘制工具下载链接:http://gap.shengxin.ren/tool/5/

1、首先我们选择一套GEO数据集GSEXXXX,然后使用GEO2R的在线工具(或者使用生信人的差异分析小工具*看这里:如何极其简单的使用GEO数据来做差异分析)筛选差异表达基因,我们将得到所有基因的差异表达情况,比如GEO2R输出的GEO2R processing request....txt文件。

文件格式:

attachments-2017-09-SpvTNbTU59cdb1332477

2、打开火山图绘制工具软件

attachments-2017-09-A2NbSe9I59cdb1157ae63、导入数据点击绘制

attachments-2017-09-9ACHGwwl59cdb1651d4f4、改改颜色,改改CutFC或者CutPvalue,还有X,Y轴的最大最小值,反正都可以试一下

5、导出PDF,就好了,最终结果如下:

attachments-2017-09-oxe21yEs59cdb1e547d6



  • 发表于 2017-09-29 10:37
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