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火山图是差异分析中最直观的可视化方式,通过火山图可以直观的观察到表达倍数的整体分布和差异显著性的整体分布,因此是做差异分析必备的可视化方式之一
在这里我们开发了简易版本的火山图绘制工具,虽说简易但展现形式不简单,不仅支持颜色、形状定制,还支持显示基因,鼠标点一点就可以,非常方便
1、输入数据,我们需要准备输入数据的三个信息,一个是 基因列,用于画火山图时 显示基因的名称,一个是 log2的表达倍数,一个是 显著性p值或者FDR(看你的需要选择),接下来就是各种调整图片了,简单明了
注意,左侧表格中第一列的复选框,用来勾选 需要在图中展示的基因
几种可视化形式如下:
1、不带背景
2、XY旋转
3、拖拽挪动文字的位置
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