宏基因组分析教程-Analysis of Metagenomic Data
加拿大安大略研究所建立的生物信息网(https://bioinformatics.ca/)，每年组织多场生物信息学线下培训，并线上共享培训资料。有超多生信学习PPT和视频，每一份都价值不菲。2016年6月22-24日，在温哥华举办了宏基因组数据分析专题培训，我们可以点击主页中宏基因组专题栏目的 "Access Content" 访问这次培训的材料。
加拿大生信网
加拿大安大略研究所建立的生物信息网(https://bioinformatics.ca/)，每年组织多场生物信息学线下培训，并线上共享培训资料。有超多生信学习PPT和视频，每一份都价值不菲。
宏基因组数据分析培训
2016年6月22-24日，在温哥华举办了宏基因组数据分析专题培训，我们可以点击主页中宏基因组专题栏目的 "Access Content" 访问这次培训的材料。 
课题内容简介
本次课题一共分为7节，简要介绍了背景、扩增子、宏基因组、宏转录组的分析思路和基本原理。同时提供全套的课件(PDF+PPT)和讲解视频(Youbute)在线。
注：本次课程以基础知识、原理讲解为主，非常适合刚入行的小伙伴认真学习。
更高级的数据分析实战课程，过几天就陆续分享给大家。
课程目录：
- 宏基因组学简介
- 扩增子分析物种组成
- 基于16S预测宏基因组
- 宏基因组物种组成
- 比较16S与宏基因测序
- 各种分析宏基因组物种组成方法
- Metaphlan2分析宏基因组样品
- STAMP统计组间物种差异
- 宏基因组功能组成
- 功能与物种组成区别
- 了解功能相关数据库
- 理解宏基因组基因拼接的优缺点
- HUMANN注释功能基因
- STAMP统计组间功能差异
- 宏转录组
- 理解宏转录组的机遇和挑战
- 宏转录组的适用范围
- 样品准备与实验设计
- 数据处理的关键步骤
- 处理简单的宏转录组示例
- 微生物组生物标记物挖掘
- 生物标记物的定义和应用
- 如何从微生物组数据中鉴定生物标记物
- 分析实战
- 理解分析的原理
资料下载
Youbute视频链接
- https://youtu.be/s_MnbWohcBM
- https://youtu.be/fZNdWbr6xEA
- https://youtu.be/0eK2ycMgVmY
- https://www.youtube.com/watch?v=YhjSDG5mMjE&feature=youtu.be
- https://youtu.be/zhHE7vbmLSE
- https://youtu.be/841EZb3GOs8
- https://youtu.be/9AZM9y7niXs
Reference
- 加拿大生信网 https://bioinformatics.ca/
- 宏基因组专题培训 https://bioinformatics.ca/workshops/2016/analysis-metagenomic-data-2016#material
- 发表于 2017-10-12 21:59
- 阅读 ( 8084 )
- 分类：其他组学
