支持两千多个芯片平台的简易ID转换工具

基因ID转换是做数据分析过程中最常见的工作,在这里我们整理了两千多个基因芯片平台的注释基因,利用genecard 进行了统一的匹配,提供了一个简易的ID转换工具。简易的输入界面: 点击 开始分...

基因ID转换是做数据分析过程中最常见的工作,在这里我们整理了两千多个基因芯片平台的注释基因,利用genecard 进行了统一的匹配,提供了一个简易的ID转换工具。简易的输入界面:

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attachments-2021-11-oQttjVjt61891e811c4bb.png点击 开始分析-》等待运行完成,在网页下方 便有转换的结果,如下:

attachments-2021-11-qWwZEpkl61891eaca5797.png举例说明:

芯片数据集:GSE51831

step1:检索到数据集:

attachments-2021-11-PgqtxKbe61891f3404eb4.png

step2: 导出表达谱

attachments-2021-11-LnKbLZH661891f6f4d869.png

step3: 另存到个人中心

attachments-2021-11-Ui0mi6n461891faec3b35.png

step4:打开 简易ID转换器,选择  已经存好的数据集,等待 导入完成:

attachments-2021-11-XAVZbt4X6189203b76562.pngstep5 选择 对应平台的注释信息,GPL10558, 选择导出 geneSymbol

attachments-2021-11-P25T25wP6189208d2956c.png点击确定,等待运行完成,在网页下方可以看到转换后的结果,其中共有47322个探针,其中有注释信息的 35998个,转换成geneSymbol共有23395个

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  • 发表于 2021-11-08 21:21
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  • 分类:软件工具

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