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RMAExpress 是斯坦福大学开发的一款芯片原始数据的RMA标准化工具,只需要导入cdf文件,然后再将GEO下载的CEL文件导入进去就可以对这些数据进行RMA标准化
操作起来极其简单
1、下载芯片平台的cdf文件
2、下载芯片的原始数据CEL
3、导入cdf文件
4、导入CEL文件
5、运行RMA标准化,其他默认
6、导出标准化后的表达矩阵,(支持取log和非取log)
后记:这种方式可以用来 合并多张同一个平台的芯片数据,具体的合并方式就是在上述的第4步中把所有的芯片原始的CEL数据导入软件即可,就是这么简便,并且速度很快,几十上百个样本在笔记本上都能处理
懒得安装的话,在SangerBox里面有免安装的插件,点开即用:
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