TCGA现有数据汇总

今天看到一篇帖子, 193种已发表植物基因组汇总,简简单单多余的东西一概没有。唤起了我很多最初的想法和感动,见贤思齐,把我整理过的东西也发一发。 截止 2018年GDC的最新一次更新后

今天看到一篇帖子,193种已发表植物基因组汇总,简简单单多余的东西一概没有。唤起了我很多最初的想法和感动,见贤思齐,把我整理过的东西也发一发。


截止2018年GDC的最新一次更新后,TCGA现存数据大致如下:



CNVFPKM/FPKM-UQmiRNA isoformclinical甲基化450K
Acute Myeloid Leukemia(TARGET-AML)急性髓系白血病285151105200140
Acute Myeloid Leukemia(TCGA-LAML)急性髓系白血病285151105200140
Adrenocortical Carcinoma(TCGA-ACC)肾上腺皮质癌18079809280
Bladder Urothelial Carcinoma(TCGA-BLCA)膀胱尿路上皮癌814433437412440
Brain Lower Grade Glioma(TCGA-LGG)脑低级别胶质瘤1019529530515534
Breast Invasive Carcinoma(TCGA-BRCA)乳腺浸润癌2223122212071097892
Cervical Squamous Cell Carcinoma and Endocervical Adenocarcinoma(TCGA-CESC)宫颈鳞状细胞癌/宫颈腺癌586309312307312
Cholangiocarcinoma(TCGA-CHOL)胆管癌8545454545
Clear Cell Sarcoma of the Kidney(TARGET-CCSK)肾透明细胞肉瘤00010
Colon Adenocarcinoma(TCGA-COAD)结肠腺癌972521465459353
Esophageal Carcinoma(TCGA-ESCA)食管癌373173200185202
Foundation Medicine Adult Cancer Clinical Dataset (FM-AD)(FM-AD)基础医学成人癌症临床数据集000420
Glioblastoma Multiforme(TCGA-GBM)多形性胶质母细胞瘤11491745596155
Head and Neck Squamous Cell Carcinoma(TCGA-HNSC)头颈部鳞状细胞癌1083546569528580
High-Risk Wilms Tumor(TARGET-WT)高危肾母细胞瘤013213820
Kidney Chromophobe(TCGA-KICH)肾嫌色细胞癌132899111366
Kidney Renal Clear Cell Carcinoma(TCGA-KIRC)肾透明细胞癌1118611616537485
Kidney Renal Papillary Cell Carcinoma(TCGA-KIRP)肾乳头状细胞癌608321326291321
Liver Hepatocellular Carcinoma(TCGA-LIHC)肝细胞癌768424425377430
Lung Adenocarcinoma(TCGA-LUAD)肺腺癌1147594567522507
Lung Squamous Cell Carcinoma(TCGA-LUSC)肺鳞癌1059551523504412
Lymphoid Neoplasm Diffuse Large B-cell Lymphoma(TCGA-DLBC)淋巴样肿瘤弥漫性大B细胞淋巴瘤9448474848
Mesothelioma(TCGA-MESO)间皮瘤17386878787
Neuroblastoma(TARGET-NBL)神经母细胞瘤0157020
Osteosarcoma(TARGET-OS)骨肉瘤00020
Ovarian Serous Cystadenocarcinoma(TCGA-OV)卵巢浆液性囊腺癌114637949958710
Pancreatic Adenocarcinoma(TCGA-PAAD)胰腺腺癌368182183185195
Pheochromocytoma and Paraganglioma(TCGA-PCPG)嗜铬细胞瘤和副神经节瘤363186187179187
Prostate Adenocarcinoma(TCGA-PRAD)前列腺腺癌1038551551500553
Rectum Adenocarcinoma(TCGA-READ)直肠腺癌317177165170106
Rhabdoid Tumor(TARGET-RT)横纹肌样瘤0550250
Sarcoma(TCGA-SARC)肉瘤522265263261269
Skin Cutaneous Melanoma(TCGA-SKCM)皮肤黑色素瘤939472452470475
Stomach Adenocarcinoma(TCGA-STAD)胃腺癌906407491443397
Testicular Germ Cell Tumors(TCGA-TGCT)睾丸生殖细胞肿瘤271156156134156
Thymoma(TCGA-THYM)胸腺瘤249121126124126
Thyroid Carcinoma(TCGA-THCA)甲状腺癌1025568573507571
Uterine Carcinosarcoma(TCGA-UCS)子宫癌肉瘤11056575757
Uterine Corpus Endometrial Carcinoma(TCGA-UCEC)子宫内膜癌1094587579548485
Uveal Melanoma(TCGA-UVM)葡萄膜黑色素瘤16080808080

红色为妇科癌症,文内表格可以直接贴回excel,TCGA这一计划已经接近尾声了,大文章也都被发的七七八八,需要挖掘的尽快挖掘,需要下载的赶紧下载。


转自:桑格助手
  • 发表于 2018-08-23 18:34
  • 阅读 ( 12688 )
  • 分类:默认分类

6 条评论

请先 登录 后评论
不写代码的码农
生信分析流

FBI

55 篇文章

作家榜 »

  1. 祝让飞 118 文章
  2. 柚子 91 文章
  3. 刘永鑫 64 文章
  4. admin 57 文章
  5. 生信分析流 55 文章
  6. SXR 44 文章
  7. 张海伦 31 文章
  8. 爽儿 25 文章