简易TCGA下载工具V8版升级简要说明

简易TCGA不知不觉已经更新到了第八个版本,之所以更新无非是有很多同志们遇到了各种各样的需求

现已全部不可用,可用的持续更新的版本在SangerBox中,下载地址:

http://sangerbox.com/


简易TCGA不知不觉已经更新到了第八个版本,之所以更新无非是有很多同志们遇到了各种各样的需求

图中是V1-V6各个版本的细节修正问题,到了V6版本基本上已经较为完善

attachments-2017-06-ElsGFKNW593bcf7adf17V7:版本主要更新的是功能,去除了Clinical功能,换成了ClearMeth,因为甲基化数据中包含了很多重复的信息,然后占空间很大,使用此功能能够将这些文件缩小,最后合并文件时对内存需求就小了,另外增加了自动识别lncRNA的功能,在ENSG_ID转换时能够同时将lncRNA表达谱提取出来

V8:首要解决了下载cnv数据后无法对应到样本中,这个版本在fileID.tmp文件第三列统一存储了样本名称,以此来对应各个数据文件的样本问题,同时优化了合并文件时的内存消耗以及断线重连时由于fileID.tmp文件的不合法问题

另外:V6之后(不包含V6)的版本已经不支持32位系统了

使用教程还是在这里:https://www.shengxin.ren/article/1

V6版本下载链接:http://pan.baidu.com/s/1pLPpa2J

V8版本下载链接:http://pan.baidu.com/s/1dELp7rF

  • 发表于 2017-06-10 19:03
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  • 分类:软件工具

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