TCGA临床病理随访资料解读

很多人问怎么计算病人的生存时间,怎么获取病人的治疗方案,怎么知道病人肿瘤转移位置等等,每个人研究关注点不同,但是TCGA提供了非常详细的病理资料以供不同的研究人员研究,今天就用胃癌作为例子简单讲解一下。

很多人问怎么计算病人的生存时间,怎么获取病人的治疗方案,怎么知道病人肿瘤转移位置等等,每个人研究关注点不同,但是TCGA提供了非常详细的病理资料以供不同的研究人员研究,今天就用胃癌作为例子简单讲解一下。

如果使用TCGA简易下载工具的同学,可以直接下载胃癌的临床资料,然后合并成矩阵就能得到每个病人的临床病理资料的矩阵文件,如果是使用其他工具下载的可能需要自己整理一下,总之TCGA对每一种类型的数据命名都是统一的,不管使用哪种工具下载只要是工具没有对其重新命名那么都可以对照本文的例子来解读,比如gender表示性别这都是通用的。

下面以TCGA简易小工具得到的胃癌临床病理资料做例子介绍一下:

首先矩阵的样子如下:

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从图中可以看出,TCGA的胃癌的临床病理共有156项,可谓是非常详细,我们常常用的无非就性别,年龄,TMN,Stage,是否转移,随访时间,是否死亡等等,从上述的表格中这些都能找到,经过王博士的努力将这156种随访信息都给解读了,随便瞅瞅如下:

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每一项都给中文标注了,送给需要的同学,如果想要获取完整版有三种方式:

1、打赏留邮箱给你发过去(直接在线支付获取下载地址,点这里)

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2、使用本社区金币在商城兑换(直接在线支付获取下载地址,点这里)

attachments-2017-06-0SU9pFu2593e364709133、直接在线支付获取下载地址,点这里


  • 发表于 2017-06-12 14:26
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  • 分类:软件工具

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