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2019-01-02 21:01 回答问题

老师你好！我想用tcga mRNA数据估算肿瘤微环境中细胞相对含量，比如通过CIBERSORT、MCPcounter等工具进行转换，输入矩阵用counts，FPKM还是TPM数据啊？

老师，只有RNA seq数据可以用这些细胞分析的工具吗？GEO下载的芯片数据可以吗？可以用这么工具分析，需要什么样的值呢