XiaoShi
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5 个回答

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TCGA数据下载工具

以前是有的,现在缺了好多数据集呢,COAD,BRCA,LUAD的都没了,哎

回答于 2020-10-02 22:17

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TCGA数据库下载下来的数据从哪里看数据的变量名代表什么含义啊?...

推荐看这个https://blog.csdn.net/qq_35203425/article/details/80851862

回答于 2019-01-10 10:41

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不同方式下载的TCGA数据出入较大

firehose的数据版本是2016年的,样本数量是不全的,不知道你有没有仔细核对

回答于 2019-01-10 10:36

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GEO里边的脑胶质瘤文章下载的数据都是肿瘤样本,没有对照组,还...

没有对照组,肯定是不能做差异分析了,建议换有对照的数据进行分析,好像没有什么别的办法。

回答于 2019-01-10 10:30

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如何打开过大的txt文件,下载了TCGA的甲基化数据,合并后文档大...

这样的大文件要分批次读取和处理,不知道你是否会python语言,python中有pandas包,可以用pd.read_csv()函数读取你的文件,需要设置一个chunksize的参数,比如设成1000,就是一次读1000行,放到for循环中处理就可以了。

回答于 2019-01-10 10:27