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RNA-seq的fpkm数据应该用什么差异分析方法？
简单看了一下，你可以下载原始raw data数据，用服务器去跑RNA-seq流程，最后得到read counts数据。据我了解 FPKM好像不能转换为counts数据，但是FPKM可以转换为TPM，用TPM做差异分析貌似也是可以，但是不提倡，好像有个软件包可以用TPM值做差异分析。
回答于 2018-09-26 00:00