mutect,muse,vanscan,somaticsniper是四种不同的预处理流程。MAF的格式一般都是tsv(制表符分隔文件)的吧,列数的多少不重要,重要的是你想要的信息,当然不同的maf文件对后续数据分析的选择性可能不同,我没做过不太清楚。 至于突变和野生型这种东西嘛,如果我没记错,MAF一行是一个突变的记录信息,突变就有一行信息,...
回答于 2018-02-05 14:37
这种问题最好查官方文档呀,再不行就谷歌嘛。 一百多页的官方文档,仔细瞧瞧 Question: edgeR normalization method Comparison of TMM (edgeR), RLE (DESeq2), and MRN Normalization Methods
回答于 2018-02-05 14:02