3 蛋白质组学文章中差异倍数选择相差很大,有没有一个标准?

经常看蛋白质组学相关的文献发现里面选择的差异倍数经常有1.2倍,1.3倍,1.5倍,2倍的,这有没有一个统一的标准,有相关文献吗?

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3 个回答

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在差异蛋白组学研究中差异倍数没有哪一篇文章有明确要求一定要超过多少倍,本身目前蛋白质组学定量大部分基于相对表达水平去定量,由于不同的软件及定量算法不同,直接导致差异倍数整体变化区间不同,所以具体问题还得具体分析。

举个例子:

看一篇Nature上的文章A cytosolic network suppressing mitochondria-mediated proteostatic stress and cell death,其中有一段如下:

attachments-2017-03-3ZEHDO0S58dde78b87c8下调选择2倍,上调选择1.266;很明显不按规矩来啊,不过人家后期验证做出来了,之所以这么选很明显是因为在这个范围内有想要的蛋白

所以蛋白组学中差异倍数的选择主要还是要看你研究的目标蛋白在哪个区间,后期能不能验证出来,这很关键。


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魏创奇 - 科研人员

赞同!这个领域主要还是根据自己的生物学问题来决定具体的差异倍数。

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王诗翔 - 研究生在读

为你的结果寻找合理的解释,而不是固定标准去探究结果。

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  • 祝让飞 提出于 2017-03-29 10:42

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