关于你看的教程我不太清楚,但Series Matrix files 是矩阵文件(即数据),其他两个是注释文件(Soft 和 Miniml)。
回答于 2018-01-16 13:47
可以用不同数据集的相同差异基因的logFC值画热图,这样可以看多个数据集同一个差异基因的表达变化。
回答于 2017-12-05 22:02
肯定不是原始数据,至于标准化方法需要参见具体的GSE研究。需要注意的是,GEO2R会将未Log的数据对数化,然后调用limma包处理。
回答于 2017-12-05 21:52