王晓明的回答 - 生信人

王晓明 - 武大硕士

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21 个回答

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请问老师，从TCGA下载临床数据，想和前面的miRNA表达谱一起进行...

我一般都是下xml的，信息比较全，其他的没用过。主要是要和你的前面做的miRNA的样本相匹配。

回答于 2018-07-08 12:15

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TCGA差异分析发现某些基因在肿瘤组织中低表达，但生存分析发现肿...

围观，同问

回答于 2018-03-10 20:28

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关于生物信息挖掘中作图的请教。

ggplot2分组散点图

回答于 2018-03-10 20:27

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生存分析问题

和表达量关系不大，主要是生存时间和生存状态

回答于 2018-03-10 20:27

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差异分析

围观水一水

回答于 2018-03-10 20:25

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请教大神：进行生存分析时，部分病人未到随访终点出现复发死亡，...

对楼上说的是对的，只有死亡才是终点事件，随访终止或结束时是活着的就不算死亡，所以死亡率也不会下降。

回答于 2018-03-10 20:24

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TCGA 简易小工具下载的CNV 片段数为什么和官网的数目不一致，是...

可以不用小工具下啊，linux的wget下就行

回答于 2018-03-10 20:22

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老师们，GEO数据转换器里ID没有gene symbol

r包clusterprofiler可以转换

回答于 2018-03-10 20:21

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TCGA数据库中肺腺癌分级G1，2，3，4在哪？

xml文件里有，搜grade能找到就像上图这样，不过的确会有缺失，但是基本能用

回答于 2018-03-10 20:20

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TCGA数据库拷贝数数据分析

围观楼上大神

回答于 2018-03-10 20:19

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