请问,
1. 做生存分析是要用TCGA直接下载的所有基因做,还是用差异筛选后的基因做?,对于同一个基因来说前后两种做法的生存分析结果是一样的吗?
2. 用FPKM做mRNA和LncRNA的相关性,需要对FPKM数据归一化吗?
1、两种结果一样,都可以,看你具体情况
2、建议做一下归一化
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和表达量关系不大,主要是生存时间和生存状态