回答问题 · 2018-07-16 20:33 TCGA数据库下载下来的数据从哪里看数据的变量名代表什么含义啊？谢谢

回答问题 · 2018-07-16 11:47 用TCGA下载的FPKM数据分析差异基因表达不是不符合正态分布吗？不能用Limma，或T检验分析差异基因，同时也不能用DEseq或edgeR分析，那如何分析FPKM数据的差异表达？

回答被采纳 · 2018-07-16 10:39 用TCGA小工具下载mRNA-seq表达数据，需要做批量生存分析和WGCNA,我看范例文章内都是下的FPKM,但我下载了FPKM数据，后期我又要做表达差异，需要用（DEseq）edgeR语言分析，又需要count数据，难道我还要再下载一次count数据吗？

回答问题 · 2018-07-16 09:02 您好，我现在想用DEcenter软件做差异基因分析，请问您有软件下载地址或者安装包吗？

回答问题 · 2018-07-16 09:00 在做TCGA-STAD 的 RNA-seq 差异分析的时候出现了这样一个问题

回答被采纳 · 2018-07-13 13:45 您好，非常感谢您回答我提出的关于使用哪种RNA数据进行分析更好的问题，我想再请教一下：如果我进行癌和癌旁差异性基因的分析，那应该是用哪种数据合适呢？是cbioptotal处理后的rsem数据还是用TCGA简易下载工具下载的三种（ count，fpkm，fp

回答问题 · 2018-07-13 12:27 GEO芯片数据转换器导出的样本信息没有分组，数据信息也没有提到分组，该如何做差异分析呢？

回答问题 · 2018-07-13 12:24 SangerBox下载数据，检索的时候，一直连不上呀。一直是在检索中，没有其他的任何反应（电脑联网了）

回答问题 · 2018-07-13 12:21 各位大神，低甲基化和高甲基化应该看哪个指标啊，看logfc的符号还是看deltaβ的符号

回答问题 · 2018-07-13 12:20 您好，非常感谢您回答我提出的关于使用哪种RNA数据进行分析更好的问题，我想再请教一下：如果我进行癌和癌旁差异性基因的分析，那应该是用哪种数据合适呢？是cbioptotal处理后的rsem数据还是用TCGA简易下载工具下载的三种（ count，fpkm，fp