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回答被采纳 · 2018-07-16 10:39 用TCGA小工具下载mRNA-seq表达数据，需要做批量生存分析和WGCNA,我看范例文章内都是下的FPKM,但我下载了FPKM数据，后期我又要做表达差异，需要用（DEseq）edgeR语言分析，又需要count数据，难道我还要再下载一次count数据吗？
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回答问题 · 2018-07-16 09:02 您好，我现在想用DEcenter软件做差异基因分析，请问您有软件下载地址或者安装包吗？
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回答问题 · 2018-07-16 09:00 在做TCGA-STAD 的 RNA-seq 差异分析的时候出现了这样一个问题
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回答被采纳 · 2018-07-13 13:45 您好，非常感谢您回答我提出的关于使用哪种RNA数据进行分析更好的问题，我想再请教一下：如果我进行癌和癌旁差异性基因的分析，那应该是用哪种数据合适呢？是cbioptotal处理后的rsem数据还是用TCGA简易下载工具下载的三种（ count，fpkm，fp
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回答问题 · 2018-07-13 12:27 GEO芯片数据转换器导出的样本信息没有分组，数据信息也没有提到分组，该如何做差异分析呢？
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回答问题 · 2018-07-13 12:24 SangerBox下载数据，检索的时候，一直连不上呀。一直是在检索中，没有其他的任何反应（电脑联网了）
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回答问题 · 2018-07-13 12:21 各位大神，低甲基化和高甲基化应该看哪个指标啊，看logfc的符号还是看deltaβ的符号
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回答问题 · 2018-07-13 12:20 您好，非常感谢您回答我提出的关于使用哪种RNA数据进行分析更好的问题，我想再请教一下：如果我进行癌和癌旁差异性基因的分析，那应该是用哪种数据合适呢？是cbioptotal处理后的rsem数据还是用TCGA简易下载工具下载的三种（ count，fpkm，fp
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回答问题 · 2018-07-13 12:18 用TCGA小工具下载mRNA-seq表达数据，需要做批量生存分析和WGCNA,我看范例文章内都是下的FPKM,但我下载了FPKM数据，后期我又要做表达差异，需要用（DEseq）edgeR语言分析，又需要count数据，难道我还要再下载一次count数据吗？
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回答问题 · 2018-07-13 11:13 想问下盒子里做完批量生存之后选取一个基因想做生存的图，想问下哪个软件可以？