hisat2+stringtie+ballgown得出的结果出现两个相同基因的FPKM值...

hisat2+stringtie+ballgown可以获得转录本的表达矩阵，也可以获得基因表达矩阵，你先看清楚你是获得啥表达矩阵，参考文献获得基因表达矩阵是没有基因名字的，需要自己去转化，按照文献的代码转录本的表达矩阵会添加上基因名字，会出现多个转录本对应一个基因名字，所以我猜你可能是用的转录本的表达矩阵吧

回答于 2020-07-01 12:03