尚目目
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2018-03-27 22:40 回答问题

要求输入数据是基因的 ENTREZ ID,而你输入的是  ENSEMBL ID。 所以解决办法就是转换基因ID,办法很多,比如 biomaRt 包,可以直接搜一下自己挑一个方法。

2018-03-14 17:11 回答问题

做生存分析最起码 Survival 包得说明书还是要看一下的。time 表示生存时间,status 表示删失,一般就是死亡\复发等这些事件发生与否,所以应该是 Status == 'Dead' 。

2018-01-12 23:26 回答问题

嗯,第一幅是基础绘图作德,第二幅是 ggplots 作。 ggplot2 先作点图,加上 jitter 参数以免点重合,然后再加上一层 boxplot 就可以了。

2017-10-07 09:15 回答问题

可以参考这篇文章:PubMed:Long non-coding RNA expression profiles predict clinical phenotypes in glioma基本思想就是自己拿芯片的探针原始序列比对 (align/map) 到 GENCODE 或者其他 lncRNA 基因组上去,相当于芯片自定义注释吧。没有搞得很清楚,只是知道大概思想。

2017-09-23 12:22 关注了问题

2017-09-21 14:31 回答问题

安装 GitHub 上的dev版,这个问题已经解决了。