如何评价基因组的组装效果？

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调研图 2017-07-02 19:13

组装基因组大小与调研图或流式细胞评估差别有多少，通常情况应该差别不大；组装指标Scaffold和Contig的n50、n90在保证组装准确性的情况下越高越好；再有利用转录组、EST等数据与组装基因组比对率及二代数据回比率；最后BUSCO、CEGMA 评估结果。