生信人下载mRAN表达值是整数，cbioptotal下载的有三位小数，生信人平台好像说过是原始数据。那意思是cbioptotal是处理过的么？我用原始的分析是不是更好？谢谢 - 生信人

生信人下载mRAN表达值是整数，cbioptotal下载的有三位小数，生信人平台好像说过是原始数据。那意思是cbioptotal是处理过的么？我用原始的分析是不是更好？谢谢

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2 个回答

祝让飞 - 生物信息工程师 2018-05-25 15:17

cbioptotal是处理后的rsem数据，你用TCGA简易下载工具下载的有三种 count，fpkm，fpkm-uq，没有谁更好，就看你怎么处理

戴瑨 - 流行病学博士 2018-05-26 22:55

用哪种数据更好取决于你的实验需求是什么，建议多看与你实验方向相近的文章，人家用什么表达量进行了何种标化方式，学着做就可以了

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海拔提出于 2018-05-24 14:54