相关性矩阵热图绘制工具使用案例

祝老师,求这个分析的矩阵文件 样本?谢谢祝老师

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1 个回答

祝让飞 - 生物信息工程师

来给你一步一步操作一下:

首先打开软件,新版的SangerBox中有,如图

attachments-2018-06-QCe8IlmO5b211633d0843.png为了防止内存不够,我先将聚类和反转这两个复选框取消勾选,然后再导入一个表达谱文件:Merge_GPL1261.expro.txt

attachments-2018-06-WXYp5pGI5b2116a6969b8.png

这个时候我们可以看到他按列进行了相关系数计算,但都是红色,因为他们的相关系数很高

这个时候,我们可以换着设置一下最小值,和点击显示系数和聚类,如下图

attachments-2018-06-8lSbT2ko5b211793c99fb.png这里就很明显这些样本之间的相关性聚类,整体上分两组。

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  • 朱文静 提出于 2018-06-13 14:38

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