3 我筛选出1000多个差异表达的lncRNA,做了批量生存分析之后,结果文件里只有400多个lncRNA了,这种情况正常吗?筛选的标准是什么?

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另外,下方km曲线中的n=73,n=74是啥意思?满足条件样本的个数吗?实际样本可以比这两个数字的和要大很多呀。

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1 个回答

调研图

先来回答第一个问题:你输入1000多个lncRNA结果只有400多个是因为数据原因导致,简单说是过滤掉的这些lncRNA数据差异特别大,没有办法进行生存分析;过滤条件样本中第25%的lncRNA表达量与第%50的表达量相同就会直接去掉;KM曲线样本的数量跟作图时候的方式有关,这里面你选择的是分位数,也就是分别取表达量最高的最低的前25%的样本,如果选择均值将会是所有样本进行KM曲线绘制。

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