盒子下载的TCGA分析

用盒子下载的TCGA数据是level几?需要标准化还是直接分析差异就行?

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调研图

1、level3的GDC数据,使用GDC-API进行下载的;

2、下载count数据用DESeq2或degR;下载FPKM可以转成TPM在进行差异分析。

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  • 小白 提出于 2018-07-31 19:03

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