GEO通过R语音分析产生差异序列分析DEG.TXT,接下来如何做heatmap分析?

GEO通过R语言分析产生差异表达分析的DEG.TXT,接下来如何产生用于heatmap分析的数据,继续做heatmap分析产生热图?

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1 个回答

调研图

1、根据DEG.TXT的差异基因ID提取表达谱数据,通过pheatmap包就可以做出来,想优化聚类图可以参考https://shengxin.ren/article/107;

2、第二种方法用SangerBox中的DEcenter进行差异分析,选择好差异分析方法;然后通过DEcenter的分析结果通过热图和火山图工具来进行作图

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