1、GEO2R：
想要对GSE数据的11例癌组织和11例配对癌旁组织（一对一）进行差异基因分析，用的应该是配对检验吧？GEO2R会自动识别并进行配对检验吗？
2、DECenter-V6简易差异基因分析软件：
（1）下载得到的GSE数据，可以直接用DECenter-V6简易差异基因分析软件中的配对t检验或Wilcoxon配对检验进行吗？
（2）应该用“配对t检验”还是“Wilcoxon配对检验”，怎么判断（正态及方差）？怎么挑选？里面数据那么多，我怎么挑选“配对t检验”还是“Wilcoxon配对检验”？
（3）在进行“配对t检验或Wilcoxon配对检验”前，还需要对GSE数据进行什么处理吗？例如，对数据进行标准化？或先进行limma、DESeq2、EdgeR2分析？
（4）另外，是不是说芯片数据用limma分析，RNA-Seq用DESeq2或EdgeR2分析？如果是这样的话，那么若对比“11例癌组织和11例配对癌旁组织”的芯片数据或RNA-Seq数据的差异基因情况，应该怎么挑选分析方法呢？
谢谢您！
