GEO数据库 affymetrix芯片 Affymetrix Human Transcriptome Array 2.0.基因注释的困惑。

我在GEO数据库的一个mRNA测序里面发现UBD这个基因有7个注释名,实际上在NCBI的GENE库 里面只有一个转录本。下面7个名字中我觉得第一个是正常的。后面的都是加了qbl,hap等等这些不知道是什么名称?每个注释名后面对应的NM号也是一样的,都是coding。请问哪位帮忙解释一下。这几个名称的区别?我该用哪个注释名的mRNA来分析,这个基因其他基因的mRNA表达的相关性?谢谢了。(我去affymetrix的官网也去看了也是这样的注释名)

TC06004113.hg.1

TC6_qbl_hap6000227.hg.1
TC6_mcf_hap5000215.hg.1
TC6_mann_hap4000198.hg.1
TC6_dbb_hap3000228.hg.1
TC6_cox_hap2000249.hg.1

TC6_apd_hap1000126.hg.1 

attachments-2018-08-8R9O6BVL5b699fdd1d317.JPG

                                          

attachments-2018-08-mbarVXlG5b699fae50e34.JPG

  

请先 登录 后评论

1 个回答

祝让飞 - 生物信息工程师

你这个是探针吧,基因组位置都不一样,应该是 多个探针 对应到了同一个基因上而已

请先 登录 后评论
  • 1 关注
  • 0 收藏,3610 浏览
  • pengtao 提出于 2018-08-07 21:36

相似问题