老师们好,我使用Sanger Box下载的TCGA GBM转录水平的Count值,然后转化为FPKM和TPM值,仔细将这些数据和使用其它方式(cbioportal及firehose)相比,数据有出入,而且有些病例和基因数值出入较大。请问,哪种方式下载的数据更可信些?谢谢!
同问,我也遇到了这样的问题不知道怎么回事