一键式wgcna运行后无结果

一、

一键式wgcna运行测试数据

运行完毕,只输出了一个报告文件和上传的两个表的一模一样的两个表,右下角框:读取文件完毕 读取文件完毕 开始运行 文本处理完毕 C:\Program Files\R\R-3.5.0\bin\Rscript.exe C:\Sanger_V1.0.8\source\softs\5bece5eb9fdd8\WGCNA_Pipline.R 开始运行R "C:\Program Files\R\R-3.5.0\bin\Rscript.exe" "C:\Sanger_V1.0.8\source\softs\5bece5eb9fdd8\WGCNA_Pipline.R" "C:\Users\asus\Desktop" "success_ExpData.txt" "success_Sam_info.txt" "1.2" "30" "unsigned" "5000" "0.25" "0.9" "2" "0.02" "-1" "1" 导出成功

wgcna,rlang,stringi,reshape2均已安装


二、找到sanger下softs文件夹,尝试运行WGCNA Pipeline,但提示Error: package or namespace load failed for ‘WGCNA’: loadNamespace()里算'GO.db'时.onLoad失败了,详细内容: 调用: dbFileConnect(dbfile) 错误: DB file '' not found


请问是什么问题

请先 登录 后评论

3 个回答

祝让飞 - 生物信息工程师

可以尝试在CMD中运行命令:

"C:\Program Files\R\R-3.5.0\bin\Rscript.exe" "C:\Sanger_V1.0.8\source\softs\5bece5eb9fdd8\WGCNA_Pipline.R" "C:\Users\asus\Desktop" "success_ExpData.txt" "success_Sam_info.txt" "1.2" "30" "unsigned" "5000" "0.25" "0.9" "2" "0.02" "-1" "1"

看看运行的提示是什么。

请先 登录 后评论
王伯当

同样的问题我也遇到


请先 登录 后评论
王宏博

遇到了同样的问题,请问楼主解决了吗?

请先 登录 后评论