TCGA-LAML和TARGET-AML有什么区别?需要合并一起分析吗?

想从TCGA中下载急性髓细胞白血病,但好像标题中的两类文件都是急性髓细胞白血病,做分析的时候需要合并在一起吗?

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3 个回答

Angie - 学生

同困惑,请问您知道区别了吗

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disciplinant - 登山爱好者

是不同的数据库中的数据;

TCGA现在的数据均收录在GDC中,而GDC同时也收录了TARGET数据库的数据,在GDC中可以通过GDC Data Portal 和 GDC Legacy Archive 这两种方式获得TCGA数据。默认情况下TCGA的数据检索和下载是通过 GDC Data Portal 方式进行的,是最新经过统一标准整理的,但有些数据还未开放。一般我们下载的是TCGA中的数据,所以你就下载TCGA-LAML的就可以了。

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Janko

同问祝老师,这两个数据是同个测序平台的吗?能通过一定标准化进行合并吗?


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