2019-06-19 21:38 回答问题

genecard（https://www.genecards.org/），基因名片，直接输入基因名称，里面有基因的所有基本信息，可以供参考。

2019-06-19 21:35 回答问题

主要是结合你的要求吧，你的研究需要分组可以根据不同的临床参数特征分组，比如分期或者是否转移等。

2019-04-18 16:34 发起提问

2019-02-26 14:30 关注了问题

2018-12-21 17:04 回答问题

是不同的数据库中的数据； TCGA现在的数据均收录在GDC中，而GDC同时也收录了TARGET数据库的数据，在GDC中可以通过GDC Data Portal 和 GDC Legacy Archive 这两种方式获得TCGA数据。默认情况下TCGA的数据检索和下载是通过 GDC Data Portal 方式进行的，是最新经过统一标准整理的，但有些数据还未开放。一般我们下载的是TCGA中的数据，所以你就下载TCGA-LAML的就可以了。

2018-11-29 15:50 回答问题

可以参考祝老师的回复。https://shengxin.ren/question/1208

2018-09-05 09:08 回答问题

是的，跟这个barcode不一致，你可以根据最后一个字段数字来区分；10以内的为癌（如01），10以上的为癌旁（如11）；供参考

2018-07-31 21:59 回答问题

最主要的还是免费，哈哈哈。。。这一点也是非常值得称道的，软件好用，还免费，简直是天上掉馅饼； 其次，我主要是下载TCGA的数据，SangerBox和之前的基本上没有差别，用起来类似，只不过链接相应的数据后，会弹出分类对话框，可能对提高速度有帮助吧，一如既往的好用； 再者，火山图也很方便，参数调整等简便易行； ID转换器、DECenter、批量计算生存分析等用起来都是不错； 其他的用的比较少，没有什么体会。。。 尝试过heatmap，可能是不太会调整参数，结果不是很理想，也就是说灵活调整性可能欠缺（

2018-07-29 21:21 回答问题

有可能是路径的问题，你打开SangerBox，点击升级，看一下系统JAVA路径，如果是有更新过的，可以再通过“选择JAVA”再走一遍路径，没有更新就可以先更新一下。我之前遇到类似的问题，回来摸索出来的。供参考。

2018-07-29 21:17 回答问题

是的，聪明！