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disciplinant - 登山爱好者

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2019-06-19 21:38 回答问题

genecard(https://www.genecards.org/),基因名片,直接输入基因名称,里面有基因的所有基本信息,可以供参考。

2019-06-19 21:35 回答问题

主要是结合你的要求吧,你的研究需要分组可以根据不同的临床参数特征分组,比如分期或者是否转移等。

2019-04-18 16:34 发起提问

2019-02-26 14:30 关注了问题

2018-12-21 17:04 回答问题

是不同的数据库中的数据; TCGA现在的数据均收录在GDC中,而GDC同时也收录了TARGET数据库的数据,在GDC中可以通过GDC Data Portal 和 GDC Legacy Archive 这两种方式获得TCGA数据。默认情况下TCGA的数据检索和下载是通过 GDC Data Portal 方式进行的,是最新经过统一标准整理的,但有些数据还未开放。一般我们下载的是TCGA中的数据,所以你就下载TCGA-LAML的就可以了。

2018-11-29 15:50 回答问题

可以参考祝老师的回复。https://shengxin.ren/question/1208

2018-09-05 09:08 回答问题

是的,跟这个barcode不一致,你可以根据最后一个字段数字来区分;10以内的为癌(如01),10以上的为癌旁(如11);供参考

2018-07-31 21:59 回答问题

最主要的还是免费,哈哈哈。。。这一点也是非常值得称道的,软件好用,还免费,简直是天上掉馅饼; 其次,我主要是下载TCGA的数据,SangerBox和之前的基本上没有差别,用起来类似,只不过链接相应的数据后,会弹出分类对话框,可能对提高速度有帮助吧,一如既往的好用; 再者,火山图也很方便,参数调整等简便易行; ID转换器、DECenter、批量计算生存分析等用起来都是不错; 其他的用的比较少,没有什么体会。。。 尝试过heatmap,可能是不太会调整参数,结果不是很理想,也就是说灵活调整性可能欠缺(

2018-07-29 21:21 回答问题

有可能是路径的问题,你打开SangerBox,点击升级,看一下系统JAVA路径,如果是有更新过的,可以再通过“选择JAVA”再走一遍路径,没有更新就可以先更新一下。我之前遇到类似的问题,回来摸索出来的。供参考。

2018-07-29 21:17 回答问题

是的,聪明!