sangerbox下载的tcga样本信息和官网数据不一致?

attachments-2018-12-4MrS2FvF5c09e076f0c8e.pngattachments-2018-12-69FpCUbH5c09e1e392445.pngtcga显示共有162个癌组织,81个腺癌样本,80个鳞癌样本,还有一个样本类型为Cystic, Mucinous and Serous Neoplasms(样本号为TCGA-L5-A43C)。工具下载(161个样本)的信息中,该样本属于腺癌类型。另外,官网的腺癌中有三个样本,在工具下载信息里,对应的是癌旁样本。请问老师,这种不一致的原因在哪里呢?

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1 个回答

祝让飞 - 生物信息工程师

工具下载的数据来源于GDC,RNA-Seq基本是是一致的,临床信息可能会存在一些不同,你浏览的统计信息和最后下载的未必一致,你下载下来再对比看看

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  • 桃叶尖上尖 提出于 2018-12-07 11:00