用tcga的RNA seq数据进行预后分析应该用表达值还是z-score

想在tcga数据库中查肝癌病人肿瘤中某个目标基因的RNA表达值然后进行预后分析,发现给出的Z-score大多数为负数,oncoprint页面给出只有2.2%病例表达上调,所以是要用这2.2%病例作为高表达组,剩余所有病例作为低表达组做预后分析吗?还是根据表达值的高低排序后按照中位值分两组?

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1 个回答

祝让飞 - 生物信息工程师

两种方式都是可以的

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