5 GISTIC如何在线分析TCGA下载的CNV数据

我用GISTIC在线分析工具如图一,seg  file是直接从TCGA下载的数据(如图二),markers file是探针文件(有100W行左右,如图三),cnv file不填

然后我每次运行的结果都是错的(如图四),有大神可以告诉我是怎么回事吗?求教

图一

attachments-2017-08-pW311Dyj59980dec234a

图二

attachments-2017-08-wScE7udt59980eb9c6fd图三

attachments-2017-08-VFZU9irG59980ecde3ae图四

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1 个回答

生信菜鸟团 - 博士在读

第一次听说这个GISTIC在线分析工具,看起来很不错呀,这个软件本来就很难用,限制条件非常多。我一般是用本地版的,http://www.bio-info-trainee.com/1648.html 软件下载安装的时候会自带测试数据,你需要仔细研究测试数据,包括探针起始终止等信息,慢慢调整

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