生信菜鸟团
生信菜鸟团 - 博士在读

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2018-01-12 11:27 回答问题

CNV数据如何找到对应的基因,这个很简单,就是需要一点点linux技术而已: 看这里: http://www.bio-info-trainee.com/2527.html 用bedtools 即可

2017-10-19 22:08 回答问题

可以,很简单, 一个RNA-seq实战-超级简单-2小时搞定!

2017-10-19 22:07 回答问题

有,从原始数据得到基因突变信息,看这个: ESCC-肿瘤空间异质性探究

2017-10-19 22:05 回答问题

RNA-seq数据并不能覆盖到所有的外显子,而且因为基因表达量的问题,每个外显子覆盖度差异很大,最后还有一个叫做allel-specific的东西,你需要去搜索学习

2017-10-19 21:56 回答问题

真的查了好多资料吗?那你应该罗列一下你查的资料,证明一下,我记得我的博客就很多这个的介绍。

2017-09-26 17:59 回答问题

只有带上了nocnv标签的文件里面存储着的才是真正的somatic CNV。 因为CNV大部分是用芯片测得的,至于你说的不患乳腺癌的reference,我没有get到你的点

2017-09-09 10:18 回答问题

所以的代码都在这里了,https://github.com/jmzeng1314/my-R/blob/master/10-RNA-seq-3-groups/hisat2_mm10_htseq.R  这么简单的我从来不注释的,包括edgeR、deseq2、limma包

2017-08-29 20:56 发表了文章

2017-08-29 20:52 发表了文章

2017-08-29 20:50 发表了文章