1、数据下载:可以使用TCGA简易小工具进行下载胃癌的表达谱数据,再从中筛选出AKT3的表达数据,使用Excel就行
2、临床病理相关性:首先要将临床病理资料整理好(简易小工具可以下载病理资料),然后再与AKT3的表达数据进行对应
3、AKT3分组:将AKT3在各个样本中的表达水平分成高中低用(0,1,2)表示
4、相关性:比如与年龄相关的话直接用AKT3表达分组之前的数据和年龄一起计算皮尔森相关系数即可,比如与T分期相关的话可以将T0、T1、T2表示成0,1,2,然后使用Spearman秩相关系数进行计算相关性即可,使用R语言的cor函数即可,例子如下