使用TCGA简易下载工具下载的TCGA表达谱数据,想要移除表达谱的批次效应,应该要怎么做呢?
当然,有sva包可以实现,但是需要不同样本的batch的信息,这个batch信息怎么获取到呢?
临床信息中并没有这个信息。
求大神指点!