5 如何去查找 使用DECenter中edgR后针对性运行的代码呢?

因为我运行DECenter分析后中找到结果,未能找到代码?想看一下是否代码中已经标准化?如果未标准化,可以用counts表达数据进行后续的生存分析吗?万分感谢

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1 个回答

调研图

edgR包自动处理counts数据,然后进行差异分析。

进行生存分析:1、TCGA数据可以直接下载FPKM;2、GEO数据可以从原始数据开始进行标准化RMA或者其他的方法;3、自己测的数据转成FPKM根据公式自己编写个程序。

也可以用工具盒里面的简易标准化工具

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  • shi'xiao'bo 提出于 2019-01-19 17:20

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