10 从TCGA中下载的RNAseq里样本名字和clinical样本名字不对应怎么解决

attachments-2019-01-UItXNmH85c4669b2df346.PNGattachments-2019-01-eQiGljO95c46699f5fa8f.PNG第一张图是RNAseq的样本名称,第二张图是clinical的样本名称,但是名字不对应,没法匹配到一起进行分析。所以,我怎么能将二者名字成功匹配?

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1 个回答

祝让飞 - 生物信息工程师

这是因为 clinical名称只是病人的ID,RNASeq的名称后面多了三位数表示哪种组织,比如-01表示tumor,-10表示normal;

所以 随访信息的单位是 病人,RNASeq的单位是病人的某个组织,ID肯定是不同的,你自己需要做一下变换

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  • 于宁 提出于 2019-01-22 08:57

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