lncRNA的GO 和KEGG分析第一步是靶基因预测嘛？一般选择哪个数据库呀？ - 生信人

lncRNA的GO 和KEGG分析第一步是靶基因预测嘛？一般选择哪个数据库呀？

生信新手，想请教一下lncRNA的吧基因预测问题，网上说很多数据库可用，是随便选一个嘛？我用LOC644656这个在starbase中search，没有结果呀。而且只能一个一个的search，最后进行GO和KEGG分析是把所有的靶基因混在一起分析嘛？求解~

0 条评论

默认排序时间排序

1 个回答

祝让飞 - 生物信息工程师 2019-02-21 19:01

lncRNA靶基因预测目前大多数网站都不全，一般做法是计算与lncRNA表达最相关的基因作为lncRNA的潜在靶基因，或者寻找lncRNA在基因组上临近的基因作为lncRNA的靶基因。