lncRNA的GO 和KEGG分析第一步是靶基因预测嘛?一般选择哪个数据库呀?

生信新手,想请教一下lncRNA的吧基因预测问题,网上说很多数据库可用,是随便选一个嘛?我用LOC644656这个在starbase中search,没有结果呀。而且只能一个一个的search,最后进行GO和KEGG分析是把所有的靶基因混在一起分析嘛?求解~

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1 个回答

祝让飞 - 生物信息工程师

lncRNA靶基因预测 目前大多数网站都不全,一般做法是 计算与lncRNA表达最相关的基因作为lncRNA的潜在靶基因,或者寻找lncRNA在基因组上临近的基因作为lncRNA的靶基因。

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