我和你出现同样的问题 请问你解决了吗 就是 WGCNA 尚未运行完毕,请稍后再试!

开始运行

文本处理完毕

C:\Program Files\R\R-3.5.1\bin\i386\Rscript.exe

H:\Sanger_V1.0.8_full64\source\softs\5c7344303916c\WGCNA_Pipline.R

开始运行R

"C:\Program Files\R\R-3.5.1\bin\i386\Rscript.exe" "H:\Sanger_V1.0.8_full64\source\softs\5c7344303916c\WGCNA_Pipline.R" "E:\医科院 实验资料\数据分析\WC" "success_expression_tumorWLL.txt" "success_FENZUwgcna.txt" "1.2" "20" "unsigned" "2000" "0.25" "0.8" "2" "0.02" "-1" "1"

导出成功

但是那个report文件只有13k  里面显示WGCNA 尚未运行完毕,请稍后再试!
  我在R里面装WGCNA的包 最后显示 安装失败:  不知道是否有关系 
                     Warning in install.packages :
  error 1 in extracting from zip file
Warning in install.packages :
  cannot open compressed file 'stringi/DESCRIPTION', probable reason 'No such file or directory'
Error in install.packages : cannot open the connection
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1 个回答

调研图

这个是WGCNA包没有安装成功,解决方法就是在运行工具前,把这个包安装成功,安装命令:

source("https://bioconductor.org/biocLite.R")

options(BioC_mirror="http://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/")

biocLite("WGCNA")

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