R包ballgown 分析TCGA的错误

利用生信人 简易工具下载了某肿瘤 癌和癌旁(或者原发和转移) mRNA seq和患者clinical的数据,然后合并,我们都知道,并不是每一例患者都有临床数据,这样,两者的例数就不相等,此外,也有可能是某些样本做了重复,导致seq数据和clincal数据例数不一致,当使用ballgown包分析,就会提示如图的错误,请教大家,有解决办法吗,或者用其他的包,能否做分析吗?谢谢!attachments-2017-09-sjnPY6Nr59aac50879d2attachments-2017-09-xjvUTFcL59aac6ab0f7d

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1 个回答

slzhong

有重复则取均值 然后seq数据和clincal数据合并

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