5 关于CIBERSORT的图

老师您好,

我是药理学研究生,在文献研究中有关于通过对TCGA中膀胱癌患者的RNA-seq数据进行CIBERSORT方法测算,以确定肿瘤浸润型免疫细胞群体的相对丰度的图,我查了很多相关资料,仍然不解。希望老师有时间能帮我解答一下,感谢!

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(G) Relative abundance of tumor-infiltrating immune cell populations determined by the CIBERSORT methodology (24) in bladder cancer patients from RNA-seq data in TCGA (n = 433) as a function of DDR2 expression. ***P < 0.001, ****P < 0.0001.


以及附录里的补充图:

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Fig. S6. Quantification of immune cell populations in bladder cancer patients with varying DDR2 expression levels. (A), Distribution of DDR2 expression in quartiles. (B), Relative abundance of tumor-infiltrating immune cell populations determined by CIBERSORT methodology (24) in bladder cancer patients from RNAseq data in the TCGA (n = 433).

*P < 0.05, **P < 0.01, ***P < 0.001, ****P < 0.0001.



原文献:  https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6382401/

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3 个回答

liu

CIBERSORT是一个网络在线工具用于计算免疫浸润,可以自己去用数据库。

附上网址:
https://cibersort.stanford.edu/

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artery - 医生

根据CIBERSORT分析的数据可得到22种免疫细胞在肿瘤中的比例,然后根据比例分组

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fenglifeng

这个网站能用于肺肿瘤组织的分析吗

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