GEO数据库geo81089的Supplementary file有两个文件,哪个是原始counts数据,哪个是已经标准化(归一化)的数据?

GEO数据库geo81089的Supplementary file有两个文件,一个的文件名是GSE81089_FPKM_cufflinks.tsv.gz,另一个是GSE81089_readcounts_featurecounts.tsv.gz。这两者哪个是原始counts数据,哪个是已经标准化(归一化)的数据?如果从文件名来看,含有FPKM关键词的文件应该是已经进行了FPKM处理了吧,也就是说已经标准化了?另一个问题:如果说FPKM是一种标准化处理办法,为什么生信人论坛里还要提FPKM转换成TPM呢(https://shengxin.ren/article/150)?TPM也是一种和FPKM并列的标准化办法呀!?

请先 登录 后评论